保护区科普教育基地坐落于广西北海市合浦县沙田镇保护区管护站中，科普教育基地宣教馆于2017年10月开馆，2018年10月获教育部全国中小学生研学实践教育基地。基地内设10个展区，展示面积3000多平方米，分为儒艮厅、鲸豚厅、海草厅和生物多样性厅等展厅，目前保护区生物标本有儒艮2副、中华白海豚3副、江豚6副、小布氏鲸2副，条纹原海豚3副、中国鲎2副、海龟3副等。以海洋生物标本、海洋生物生活模拟场景、海洋生物模型等向观众展示和科普北部湾珍稀海洋生物形态特征、生活习性、栖息环境以及威胁和保护等知识，展示了丰富多彩的海洋生物世界，以“保护珍稀海洋生物”为主题，突出“关爱水生野生动物，保护海洋生态环境，维护生物多样性”的理念。
